Here is a list of all documented class members with links to the class documentation for each member:

- e -

• E : LocARNA::AlignerP
• edge_end_t : LocARNA::Alignment
• edge_ends_t : LocARNA::Alignment
• EdgeEnd() : LocARNA::EdgeEnd
• edges_t : LocARNA::Alignment
• el_pat_vec : LocARNA::EPM
• elem() : LocARNA::Alphabet< T >
• elem_t : LocARNA::Matrix< T >
• elem_type : LocARNA::Alphabet< T >
• elem_vector_type : LocARNA::Alphabet< T >
• element() : LocARNA::SparseMatrix< T >::element , LocARNA::SparseVector< T >::element
• Emat : LocARNA::AlignerN
• empty() : LocARNA::AnchorConstraints , LocARNA::MultipleAlignment , LocARNA::RnaStructure , LocARNA::SequenceAnnotation , LocARNA::SparseMatrix< T > , LocARNA::SparseVector< T >
• empty_instance() : LocARNA::SequenceAnnotation
• end() : LocARNA::Alphabet< T > , LocARNA::ArcMatches , LocARNA::EPM , LocARNA::SparseVector< T > , LocARNA::MultipleAlignment , LocARNA::RnaStructure , LocARNA::SparseMatrix< T >
• endA() : LocARNA::AlignerRestriction
• endB() : LocARNA::AlignerRestriction
• EPM() : LocARNA::EPM
• Eprime : LocARNA::AlignerP
• Erev : LocARNA::AlignerP
• Erev_mat : LocARNA::AlignerP
• Es_ : LocARNA::AlignerImpl
• evaluate() : LocARNA::Aligner
• ExactMatcher() : LocARNA::ExactMatcher
• exclusion : LocARNA::ScoringParams , LocARNA::Scoring
• exists_arc() : LocARNA::BasePairs
• exists_inner_arc_match() : LocARNA::ArcMatches
• exp_arcmatch() : LocARNA::Scoring
• exp_basematch() : LocARNA::Scoring
• exp_gapA() : LocARNA::Scoring
• exp_gapB() : LocARNA::Scoring
• exp_indel_opening() : LocARNA::Scoring
• exp_indel_opening_loop() : LocARNA::Scoring
• exp_params() : LocARNA::McC_matrices_base
• explicit_scores() : LocARNA::ArcMatches
• expMLbase() : LocARNA::McC_matrices_base
• expMLbase_ : LocARNA::RnaEnsembleImpl
• ExtRnaData() : LocARNA::ExtRnaData
• ExtRnaDataImpl() : LocARNA::ExtRnaDataImpl