- e -

• EdgeEnd() : LocARNA::EdgeEnd
• elem() : LocARNA::Alphabet< T >
• element() : LocARNA::SparseMatrix< T >::element , LocARNA::SparseVector< T >::element
• empty() : LocARNA::MultipleAlignment , LocARNA::RnaStructure , LocARNA::SequenceAnnotation , LocARNA::SparseMatrix< T > , LocARNA::SparseVector< T > , LocARNA::AnchorConstraints
• empty_instance() : LocARNA::SequenceAnnotation
• end() : LocARNA::Alphabet< T > , LocARNA::ArcMatches , LocARNA::EPM , LocARNA::MultipleAlignment , LocARNA::RnaStructure , LocARNA::SparseMatrix< T > , LocARNA::SparseVector< T > , LocARNA::Alphabet< T >
• endA() : LocARNA::AlignerRestriction
• endB() : LocARNA::AlignerRestriction
• EPM() : LocARNA::EPM
• evaluate() : LocARNA::Aligner
• ExactMatcher() : LocARNA::ExactMatcher
• exclusion() : LocARNA::Scoring
• exists_arc() : LocARNA::BasePairs
• exists_inner_arc_match() : LocARNA::ArcMatches
• exp_arcmatch() : LocARNA::Scoring
• exp_basematch() : LocARNA::Scoring
• exp_gapA() : LocARNA::Scoring
• exp_gapB() : LocARNA::Scoring
• exp_indel_opening() : LocARNA::Scoring
• exp_indel_opening_loop() : LocARNA::Scoring
• exp_params() : LocARNA::McC_matrices_base
• explicit_scores() : LocARNA::ArcMatches
• expMLbase() : LocARNA::McC_matrices_base
• ExtRnaData() : LocARNA::ExtRnaData
• ExtRnaDataImpl() : LocARNA::ExtRnaDataImpl