Here is a list of all struct and union fields with links to the structures/unions they belong to:
- g -
- GAS_CONSTANT_R : ell::LandscapeTopology
- getAllMin() : ell::LT_MinimaSet
- getAvgSaddleEnergy() : ell::LT_SaddleNet , ell::LT_SaddleNet_AM
- getBarrier() : ell::LT_BarrierTree
- getDistance() : ell::LT_MinimaSet , ell::LT_SaddleNet , ell::LandscapeTopology , ell::LT_SaddleNet , ell::LT_AutoFlood , ell::LT_BarrierTree , ell::LT_Funnels
- getEnergy() : ell::RNAFreeEnergy_TB , ell::S_RNAfe_SingleM , ell::S_RNAfe_SingleM_TB , ell::S_LP , ell::S_Explicit , ell::S_SG_Ising , ell::S_LP , ell::S_SG_NPP , ell::State , ell::SC_PartitionFunction , ell::RNAFreeEnergy , ell::SC_PartitionFunction_Shifted
- getHighestParentLEQ() : ell::LT_BarrierTree
- getID() : ell::S_RNAfe_SingleM , ell::S_RNAfe_SingleM_TB , ell::State , ell::S_Explicit , ell::S_SG_Ising , ell::S_SG_NPP , ell::State , ell::S_LP_PullM
- getIterations() : ell::DW_RNA_MorganHiggs
- getLastAdded() : ell::SC_Counting , ell::SPC_Counting , ell::SC_Counting , ell::SPC_Counting , ell::StateCollector , ell::SC_Counting , ell::SC_Listing , ell::SC_ListingK , ell::StatePairCollector , ell::SPC_Counting , ell::SPC_Listing
- getLCA() : ell::LT_BarrierTree
- getList() : ell::SC_Listing , ell::SC_ListingK , ell::SC_ListingCompr , ell::SPC_Listing
- getLocalMin() : ell::MinimumMapping , ell::MM_GradientWalk
- getMaxE() : ell::util::PriorityQueue< QV, QK, CompareKey >
- getMaximumState() : ell::SC_Maximum
- getMaxLength() : ell::WAC_MaxLength
- getMFEState() : ell::LT_MinimaSet , ell::LandscapeTopology , ell::LT_SaddleNet_AM , ell::LT_AutoFlood , ell::LT_Funnels , ell::LandscapeTopology
- getMin() : ell::LT_MinimaSet , ell::LandscapeTopology , ell::LT_SaddleNet_AM , ell::LT_MinimaSet , ell::LT_Funnels , ell::LT_AutoFlood , ell::LandscapeTopology
- getMinCount() : ell::LT_MinimaSet , ell::LT_SaddleNet_AM , ell::LandscapeTopology , ell::LT_AutoFlood , ell::LT_MinimaSet , ell::LT_Funnels
- getMinimalDistance() : ell::S_RNAfe_SingleM , ell::S_Explicit , ell::State , ell::S_SG_Ising , ell::State , ell::S_LP_PullM , ell::S_RNAfe_SingleM_TB
- getMinIndex() : ell::LT_AutoFlood , ell::LT_MinimaSet , ell::LT_SaddleNet_AM , ell::LandscapeTopology , ell::LT_Funnels , ell::LandscapeTopology , ell::LT_MinimaSet
- getMinPair() : ell::SPC_MinPair
- getNeighbor() : ell::S_LP , ell::S_Explicit , ell::S_SG_Ising , ell::IterableNeighbors , ell::S_SG_NPP , ell::S_LP
- getNeighborList() : ell::NG_Random , ell::S_RNAfe_SingleM , ell::S_SG_Ising , ell::S_LP , ell::NG_SuccessiveRandom , ell::S_RNAfe_SingleM_TB , ell::S_LP , ell::S_Explicit , ell::S_SG_Ising , ell::NeighborGenerator , ell::NG_Successive , ell::State
- getNeighborNumber() : ell::S_SG_Ising , ell::S_Explicit , ell::S_LP , ell::IterableNeighbors , ell::S_LP , ell::S_SG_Ising
- getNodeEnergy() : ell::S_Explicit::LandscapeGraph
- getNumOfLeaves() : ell::LT_BarrierTree
- getNumOfTrees() : ell::LT_BarrierTree
- getRandomNeighbor() : ell::S_SG_NPP , ell::S_LP , ell::S_Explicit , ell::S_RNAfe_SingleM , ell::S_LP , ell::S_RNAfe_SingleM_TB , ell::S_SG_Ising , ell::State
- getRandomNeighborList() : ell::S_LP , ell::S_RNAfe_SingleM_TB , ell::S_Explicit , ell::S_SG_Ising , ell::S_RNAfe_SingleM , ell::State
- getSaddle() : ell::LT_SaddleNet , ell::LT_SaddleNet_AM
- getSaddleNumber() : ell::LT_SaddleNet , ell::LT_SaddleNet_AM
- getSequence() : ell::S_RNAfe_SingleM , ell::S_RNAfe_SingleM_TB
- getSequenceAlphabet() : ell::RNAFreeEnergy , ell::RNAFreeEnergy_TB
- getSortedMinimaDistance() : ell::LandscapeTopology
- getStructure() : ell::S_RNAfe_SingleM_TB , ell::S_RNAfe_SingleM
- getSymmShift() : ell::S_SG_NPP
- getWeights() : ell::S_SG_NPP
- getZ() : ell::SC_PartitionFunction_Shifted , ell::SC_PartitionFunction