@article{backofen10:_ident_von_klein_regul_rnas,
author = {Backofen, Rolf},
title = {{Identifikation} von {Targetmolekülen} kleiner
         regulatorischer {RNAs}},
journal = {Laborwelt},
year = {2010},
doi = {},
volume = {11},
user = {backofen},
pages = {29-30},
number = {1},
abstract = {Nicht-codierende, kleine RNAs (sRNAs) spielen eine
            wichtige Rolle in der Genregulation. Studien an
            prokaryotischen und eukaryotischen Zellen zeigen, dass
            diese sRNAs häufig über die Paarung komplementärer
            Basen an mRNA-Zielsequenzen (ta-mRNA) binden, um die
            Expression bzw. Translation der entsprechenden Gene zu
            regulieren. Die Spezifität dieser Interaktionen hängt
            von der Stabilität der inter- und intramolekularen
            Basenpaarungen ab. Neue Techniken wie das Deep
            Sequencing identifizieren zwar extrem viele sRNAs. Da
            aber keine Hochdurchsatzmethoden zur Verfügung stehen,
            um die zugehörigen Target-RNAs zu identifizieren und
            somit den sRNAs eine Funktion zuzuschreiben, und weil
            die experimentellen Methoden mit grossem Aufwand
            verbunden sind, ist die rechnergestützte
            Target-Vorhersage, gefolgt von einer experimentellen
            Analyse vielversprechender Kandidaten der derzeit
            effizienteste Ansatz, Ziel-RNAs zu
            identifizieren. Allerdings ist auch die 
            rechnergestützte Vorhersage von Targetsequenzen
            aufgrund der häufig unvollständigen
            Sequenzkomplementarität oft eine Herausforderung. Hier
            beschreiben wir derzeit aktuelle Methoden zur
            Targetsequenz-Vorhersage.}
}